Gachiakuta – Penduduk sebuah kota kaya hidup dengan mudahnya membuang barang-barang mereka. Namun, bagi Rudo, anak laki-laki yang tinggal di kawasan kumuh kota itu, sampah tersebut justru sangat berharga. Meski terus diperingatkan oleh ayah angkatnya, Regto, Rudo tetap menghabiskan hari-harinya mencari benda-benda yang masih bisa digunakan sebelum semuanya dikirim ke tempat pembuangan raksasa bernama Pit. Karena luasnya yang tak terbayangkan, Pit juga dijadikan tempat hukuman bagi para penjahat; siapa pun yang dijatuhkan ke sana tak akan pernah kembali.
Ketika Regto dibunuh oleh seseorang yang misterius, Rudo dijebak sebagai pelakunya dan akhirnya dilemparkan ke dalam Pit. Tak disangka, ia terbangun di wilayah penuh sampah yang dihuni monster-monster raksasa yang terbentuk dari tumpukan barang rongsokan. Saat udara beracun dan para Trash Beasts hampir merenggut nyawanya, Rudo diselamatkan oleh Enjin, salah satu Cleaner yang menggunakan senjata bernama Vital Instruments untuk melawan makhluk-makhluk itu. Setelah memperoleh Vital Instrument-nya sendiri, Rudo pun bergabung dengan para Cleaner dengan harapan dapat menemukan jalan keluar dari Pit dan membalas kematian ayahnya.
